Yaşamın sınırlarını zorlayacak projede liderlik YDÜ'de

   Yakın Doğu Üniversitesi, 11 Haziran 2007 tarihinde, IBM Türk ile "YDÜ- IBM İnovasyon Merkezi" kurulması hakkında protokol antlaşması imzalayarak, KKTC'de bir ilki daha gerçekleştirmişti.

   Yapılan antlaşma kâğıt üzerinde kalmadı ve süper bilgisayarın kurulum çalışmaları aynı gün, törenden hemen sonra başlatıldı ve Nisan 2008 başında da süper bilgisayarın tüm kuruluş çalışmaları ve denemeleri tamamlanarak bilim dünyasına kazandırıldı.

   12 Terra Baytlık işlem hızı ile "YDÜ-IBM İnovasyon Merkezi" Doğu Avrupa, Ortadoğu, Orta Asya ve Kuzey Afrika'da tek olurken, işlem hızına göre de dünyada "En iyi 500 listesinde" ilk 100'ün ortalarına oturuverdi. Ülkeler bazında 13., dünya üniversiteleri arasında 12. sırada yerini aldı.

   YDÜ-IBM İnovasyon Merkezi'ndeki Süper bilgisayarlar aslında iki tane. Birisi tüm işlemleri ve matematiksel analizleri yapan, diğeri de bu sonuçları insanların algılayabileceği şekilde görsel veya yazılı hale getiren bilgisayar.

   Analizleri yapan birinci süper bilgisayar, dörder çekirdekli İntel işlemcilerin kullandığı toplam 1280 çekirdeğe sahip ve 12 Terra byte işlem kapasiteli. Terra kelimesi Latincede trilyonun karşılığı olup 12 adet sıfırla veya 10 üzeri 12 tanımı ile ifade edilmektedir.

   İkincisi ise 3 Terra byte işlem kapasiteli ve IBM'in yeni nesil Cell teknolojisi esasında kurulu. Özellikle grafiksel tasarımlar, moleküler modelleme, sonlu elementler analizi ve işlemsel akışkanlar mekaniği gibi araştırmalara daha uyumlu bir süper bilgisayar. Bu bilgisayarın temel özelliği, birinci bilgisayarın ürettiği sonuçları büyük bir ekranda görsel olarak kullanıcıya sunması ve görüntüleri anında üç boyutlu hale çevirebilmesi.

   Aralık 2007'de yoğun bir uzman trafiğinin yaşandığı bayram sürecinde ekibe, Amerikalı uzmanların da katılımıyla bilgisayar, nihai yeri olan İnnovasyon merkezi odasına taşındı ve 24 saatlik vardiyalar halinde çalışan YDÜ ve IBM ekipleri 9 büyük kara kutu şeklinde görünen bilgisayarı kilometrelerce kablo kullanarak birbirine bağladı. 24 Aralık 2007 Pazartesi günü bilgisayara ilk kez elektrik verildi ve "Süper Bilgisayar" insanlığa hizmet etmek için gözlerini açtı.

   YDÜ-IBM İnovasyon Merkezi'ndeki Süper bilgisayarlar kişiye özel gen bazlı ilaç üretimi, iklim değişikliklerinin sebeplerinin anlaşılması, biyoloji, nano teknoloji, uzay araştırmaları, ekolojik analizler ve bilimsel alanlardaki her tür çalışmalarda kullanılacak.

   IBM'nin desteği ile Hauptman Woodward Araştırma Enstitüsünde insan yaşamının sınırlarını zorlayacak "Kanseri Fethedelim" adlı büyük bir proje yürütülüyor.

   Söz konusu proje kanserin oluşumu, gelişmesi ve tedavisini anlayabilmek amacıyla vücuttaki proteinleri inceliyor ve kanser oluşan yerlerdeki proteinlerin görev ve davranışını bilimsel olarak çözmeye çalışıyor. Projenin esas amacı ise hücrelerdeki kristalleşmenin sürecini anlamayı geliştirmek ve kristalleşmeye uygun koşulları taşıyan proteinlerin analizini yapmak.

   İnsan vücudunda 9,400 tür protein bulunuyor ve bu proje kapsamında her proteinde 1,536 değişik deney ve analiz yapılıyor, sonuçlar bilgisayarlara yükleniyor ve sonuç bekleniyor.

   İçinde bulunduğumuz günün teknolojisi ile bu projedeki deneylerin sonucunu almak birkaç yüz yıl gerektiriyor. Bu süreci kısaltmak amacı ile IBM'in bilgisayarlar arasında bir ağ oluşturdu ve bu ağ sayesinde projenin bölünebilir parçaları dünyadaki çeşitli bilgisayarlar arasında bölüştürüldü. Ağın içinde 60'ı üniversite olmak üzere 370 kurum ve PC olarak tanımladığımız 370,000 den fazla da masa üstü kişisel bilgisayar var.

   "YDÜ İnovasyon Merkezi"nde bulunan birinci süper bilgisayarın yüzde 10 kapasitesi bu projede çalışmak üzere ayrıldı. 18 Nisan tarihi itibarı ile YDÜ süper bilgisayarı, 1 yıl 144 gün 3 saatlik işi sadece 5 günde tamamlayarak bu insanlık yararına olan tatlı yarışta birincilik bayrağını ele geçirdi.

   "YDÜ İnovasyon Merkezi"nin "Kanseri Fethedelim" adlı araştırma projesine katkı koymak için çalışma gruplarına giriş tarihi 9 Nisan ve araştırmalara katkı koyma tarihi 14 Nisan olmasına rağmen, 19 Nisan sonuçlarına göre Yakın Doğu Ekibi (neu-innova) 1. sıraya yükseldi. 

   İlk çalışma günü olan 14 Nisan'da neu-innova'nın "Dönüm noktası" sonuçları 150,000 iken bu sonuçlar 18 Nisan'da 700 bine, 19 Nisan'da da 877,348'e yükseldi. 

   "YDÜ İnovasyon Merkezi", dünya üzerinde çeşitli konularda araştırma yapan 73,316 ekibin arasına 15 Nisan tarihinde, yani katılımının ilk gününde, aldığı sonuçlarla 21,383'üncü sıradan girdi. 16 Nisan'da 9,217'nciliğe 17 Nisan'da 5,025'inciliğe ve 18 Nisan'da 4,161'inciliğe yükseldi.

   Bugün itibarı ile ülkeler arası sıralamada 2. konumda, tıbbi, elektronik, uzay, nano teknoloji gibi çeşitli konularda araştırma yapan 73,316 araştırma ekibi arasındaki genel sıralamada 877,348 puanla 146. sırada ve "Kanseri Fethedelim Projesi"nde ise 1.ci konumda lider durumunda.

   Bu yazı konusu sonuçların her gün değiştiği bilgileri, aşağıdaki sitelerden alabilirsiniz. 

http://stats.kwsn.net/user.php?proj=wcg&cpid=e7b01b48accec90e484c86270c48b4f2

http://stats.kwsn.net/team.php?proj=wcg&teamid=19478